Основними недоліками ЕКО для матері є підвищений ризик розвитку наступних станів:

• Синдром гіперстимуляції яєчників – ймовірність при правильному проведенні ЕКО не перевищує 1-4%. …
• Позаматкова вагітність – найчастіше розвивається у фалопієвій трубі та обумовлена ​​порушенням її функції.

Абсолютні протипоказання до ЕКО: психічні захворювання; патології матки, що призводять до неможливості імплантації ембріонів та виношування вагітності; злоякісні новоутворення, у тому числі в анамнезі; тяжкі захворювання органів (порок серця, 3 ступінь діабету, гіпертонія 2-3 стадії, патології нирок тощо).

Насправді жодних видимих ​​відмінностей ЕКО–дітей від дітей, зачатих природним шляхом, немає. Відрізняється лише сам процес зачаття. Під час проведення процедури ЕКО медичне вторгнення відбувається тільки на етапі з'єднання статевих клітин обох батьків, а також при переносі ембріонів до матки.