Між шорстким і гладким ЕР є морфологічна відмінність: мембрани шорсткого ЕР усіяні безліччю рибосом, тоді як гладкий ЕР немає зв'язаних рибосом.
Розрізняють два види ендоплазматичної мережі: Гладку (агранулярну, аЕС), представлену трубочками, які анастамозують між собою та не мають на поверхні рибосом; Шорсткувату (гранулярну, грЕС), що складається також зі з'єднаних між собою цистерн, але вони вкриті рибосомами.
ЕПС відноситься до одномембранних органоїдів клітини. Мембрани ЕПС відходять від зовнішньої мембрани ядра і за будовою подібні до неї. Ендоплазматична мережа ділиться на гладку (агранулярну) та шорстку (гранулярну). Остання усіяна прикріпленими до неї рибосомами (через це і виникає «шорсткість»).
Гладкий ендоплазматичний ретикулум клітин печінки бере активну участь у нейтралізації різноманітних отрут. Ферменти гладкого ЕПР приєднують до молекул токсичних речовин гідрофільні радикали, внаслідок чого підвищується розчинність токсичних речовин у крові та сечі, і вони швидше виводяться з організму.