Внутрішня, щільна частина капелюшки називається м'якоттю; зверху вона захищена тонкою шкіркою (кутикула, або пілеіпелліс), на нижній поверхні несе гіменофор зі спороносним шаром гіменем. Тип гіменофора (гладкий, трубчастий, пластинчастий тощо) також важливий для визначення як великих груп грибів, і окремих видів.

А разом ніжка і капелюшок, тобто надземна частина гриба, називаються плодове тіло.

Міцелій (грибниця) – вегетативне тіло грибів та актиноміцетів (деякі дослідники, підкреслюючи бактеріальну природу актиноміцетів, називають їх аналог грибного міцелію тонкими нитками), що складається з тонких (1,5-10 мкм товщиною у грибів і 0,5-1,0 мкм у актиноміцетів) розгалужених ниток, званих гіфами.