В Алтайському краї живуть два види: ховрах довгохвостий і ховрах червонощокий.
Алашанський ховрах (лат. Spermophilus alashanicus) – це вид з роду євразійських ховрахів (Spermophilus).
У його складі виділяють 15 сучасних видів та 4 вимерлих:
- Алашанський ховрах (Spermophilus alashanicus)
- Spermophilus brevicauda.
- Європейський ховрах (Spermophilus citellus)
- Даурський ховрах (Spermophilus dauricus)
- Червонощокий ховрах (Spermophilus erythrogenys)
- Жовтий ховрах (Spermophilus fulvus)
Великий, або рудуватий ховрах (Spermophilus major) – гризун роду ховрахів.