Процедуру виконують під контролем ультразвуку або рентгеноскопічної установки C-дуги. Хірург робить прокол за допомогою спеціальної пункційної голки Чіба та вводить її кінець у ниркову балію. Через голку вводять провідник і її витягають..

Вилучення нефростоми виробляється в стерильній операційній. Перед вилученням пристрою потрібно оцінити, чи може сечовидільна система функціонувати самостійно. Для цього трубка заповнюється спеціальним розчином. Під час рентгенографії він забезпечує органам чітку перегляданість.

Основними показаннями до проведення черезшкірної пункційної нефростомії є: сечокам'яна хвороба (камені нирок, сечоводу), пухлини нирок та сечоводу, простати, доброякісна гіперплазія передміхурової залози (аденома простати), заочеревинний фіброз (хвороба Ортуру).

У ході черезшкірної пункційної нефростомії лікар проколює шкіру, підшкірну клітковину, м'язи та тканини. нирки спеціальною пункційною голкою Чіба. Слідом за голкою він вводить провідник, яким далі заводяться дилятатори для розширення каналу і дренажний катетер.